建筑工程系是山东水利职业学院教学系统中的一个重要系部之一，是培养建筑业高素质、高技能的高等职业技术人才的基地（自2000年以来为社会培养了建筑类专业合格毕业生15000名）。
现设有建筑工程技术、工程监理、建筑装饰工程技术、土木工程检测技术、建筑工程项目管理专业。其中建筑工程技术专业、建筑装饰工程技术专业是教育部与建设部建设行业技能紧缺人才培养重点建设专业。建筑工程技术专业是水利部示范建设专业，还是山东省高等学校特色专业，建筑技术实训基地是中央财政支持的国家级实训基地。
建筑工程系拥有一支知识结构与学历层次合理、职业经历丰富、职教能力强的专任教师队伍和兼任教师队伍，获山东省高校优秀教学团队称号。教师中获得国家注册监理工程师、结构师、造价工程师、建造师、岩土工程师等职业（执业）资格证书的“双师型”教师达到80%以上。
建筑工程系各专业实训教学手段完善，拥有供教学、生产和科研综合使用的测量实训场、土工实训室、建材实训室、建筑施工实训场、CAD专业机房、力学试验室、土木检测实训室和65个校外实习基地。其中土工实训室、建材实训室分别具有山东省建设厅颁发的乙级资质和山东省水利工程试验室贰级资质，在满足教学的前提下，积极开展对外生产服务。在实践性教学中，特别强化了建筑工程识图、建筑工程测量、建筑材料与检测、工程造价等技术文件编制、施工工艺设计与操作等五大技能训练，同时增加了学生岗前综合实训和顶岗实习的时间，学生毕业前需获得施工员、预算员等职业资格证书，目前证书获得率为100%，增强了就业竞争能力。
由于师资力量雄厚，实习实训设施和手段完善，专业和课程改革不断深入，学生动手能力强，就业率高，办学特色突出，目前在校生达2000人。
