菌物所实验室面积为1000 m2，该实验室下设“菌物分子生物学实验室”、“菌物化学实验室”、“菌物生物学实验室”、“菌物栽培实验室”、“菌物多样性实验室”、“菌物酶学实验室”和“菌物标本馆”等。拥有人工气候室、高效液相色谱、透射电子显微镜、真空冷冻干燥机、基因枪、pcr仪、发酵罐、多导生理记录仪、离心机、薄层扫描仪、紫外分光光度计、薄层切片机、酸度离子仪、生物显微镜、实体解剖镜、真空冷冻干燥机、多用电泳仪、全自动灭菌器、超低温冰箱等实验设备，价值近千万余元。
专兼职研究人员8人，教授4人，硕士生导师4人，博士生导师2人，在读硕士、博士研究生和博士后研究人员共21人。由从事菌物资源学、分子生物学、活性成分、质量评价、栽培育种和新产品开发等方面研究的教授、专家组成了创新群体，对菌物从不同的侧面进行深入系统地开发研究。
实验室研究方向：
菌物生物学、菌物化学、菌物资源学、分子菌物学、菌物栽培育种学、菌物质量评价和菌物新产品研发等方向。
实验技术：
菌物质量评价实验技术、菌物化学成分的提取、分离、纯化和鉴定实验技术、筛选活性成分的药理实验技术、菌物菌种的保藏实验技术、菌物的栽培育种和发酵培养实验技术及菌物分子生物学技术。
研究成果：
李玉教授从事菌类工程研究30余年，坚持基础研究与应用研究和技术开发相结合，建立了食用菌业高新技术园区和21个产业化示范基地，筛选并培育出39个食药用菌品种在生产上应用，研制4个新型菌物功能食品并转让，创造并推广6种产业化新模式和3种生产新工艺，累计创产值15.58亿元，经济效益显著。
创办了菌物研究所和《菌物研究》杂志，创建了食药用菌专业、建成相关的博士点和博士后流动站并成为省部级重点学科、国家重点实验室（培育基地）。发表学术论文200余篇，出版学术著作和译著30余部。承担国家自然科学基金和科技攻关项目30余项。获吉林省科技进步一、二、三等奖各1项及推广二等奖1项。
