山东农业工程学院兽医兽药研究所由以理论研究及生物高技术研究为核心的知识创新机构和以成果转化、产业开发为核心的技术创新机构两大部分组成，围绕兽医兽药的基础理论和临床动物疾病防控新技术而申报课题、展开研究，使之尽快与生产实际相结合，并补充和丰富兽医兽药专业的课程教学内容。
研究所设有禽病研究室、猪病研究室、新兽药开发研究室三个研究机构；研究人员10人，其中基础兽医学、预防兽医学、临床兽医学教授4名，兽医药理学博士生1名，硕士生2名。
研究所始终以追踪国内外兽医兽药研究新动向做为工作宗旨、把兽医兽药研究新技术新成果与畜牧兽医生产实际相结合做为主要任务，以科技创新为工作目标，承担动物医学相关领域的科研项目，探索和解决与其相关的有关科技问题。研究所将为动物疫病防控技术的发展与进步，为新兽药的研究开发做出应有的贡献。
