经济管理系成立于2004年，所属经管类专业是甘肃农业职业技术学院传统骨干专业群之一。
自1964年起开设农业会计专业，1984年开设农业经济管理专业，1985年起先后开设乡镇企业管理、会计与统计等专业。进入90年代随着我国经济管理体制的不断变革，学校适应市场经济及社会需要及时开设了经济贸易、会计电算化、农业产业化经营与管理、市场营销、物流管理等新型专业，现已形成以会计电算化、物流管理和计算机应用技术为核心的专业群。现开设有会计电算化、财务管理、物流管理、市场营销与策划、经济管理、计算机应用技术、计算机网络技术7个专业，在校学生1200余人。
经济管理系拥有一支教学经验丰富,职称、学历、年龄结构合理的师资队伍。现有教职工34人，其中专职教师23人，兼职教师11人。教师中具有教授职称1人，副教授职称6人，中级职称15人；具有研究生学位的教师8人，“双师”型教师10人。他们爱岗敬业，勤于耕耘，治学严谨，教学业务能力强。从2004年以来，我系教师在全国经济学、管理学、会计学、计算机、教育学等期刊上发表专业学术论文近百篇；主编或参编公开出版教材15部，主持或参与科研项目8项，其中省部级以上课题5项。
校内建有会计手工模拟实验室一个、会计电算化实验室一个、物流模拟实验室一个，专业计算机房七个，设备先进，软件齐全，实训资料完备，设备利用率高。所有实验室均有专业的实验管理人员专门管理。
为实现“工学结合”教学模式，锻炼学生综合素质，拓宽学生就业渠道，经济管理系积极开展校企交流与合作，先后与甘肃益诚会计服务有限公司、兰州蒋氏农产品有限公司、永靖县农林局、甘肃联合快递有限责任公司、兰州瑞森科技有限公司等多家单位和企业建立了校企合作关系，保证每个专业都有对口合作企业，为学生实习实训及就业提供条件。
经济管理系非常重视学风、班风建设，致力于全面提高学生的综合素质，引导学生全面发展。注重培养学生的实践能力与创新能力，采取专门措施，鼓励学生在学好本专业知识的同时，努力参加社会实践和科研活动。在校内经常性地开展 “财会技能竞赛”、“会计电算化技能竞赛”，“用友ERP沙盘模拟经营竞赛”、“计算机技能竞赛”、“大学生辩论赛”、“演讲比赛”等形式多样、富有特色的学生技能竞赛活动。2007年参加全省首届高职财会技能竞赛，获得了团体总分第二的好成绩，有多位同学在单项比赛中取得了第一名。2008年、2009年连续两年参加“‘用友杯’全国大学生ＥＲＰ技能大赛”，都获得甘肃省第一名，全国一等奖的好成绩。2009年参加‘用友杯’全国大学生创业设计暨沙盘模拟经营大赛，获得甘肃赛区总决赛第三名。
