菏泽医学专科学校专升本成绩连续多年保持领先，得到社会各界的充分肯定，保持了菏泽医学专科学校专升本良好声誉。2018年菏泽医学专科学校师生不负众望，再次取得优异成绩。2018年菏泽医学专科学校参加专升本考试2856人，录取621人，录取人数占山东省同类专业招生计划数的28.36%，各专业平均录取率为21.74%。 临床医学专业为首批全国职业院校健康服务类示范专业点，中央财政支持重点建设专业，省级特色专业。2018年临床医学专业专升本人数占全省招生计划39.74%，遥遥领先于山东省同类院校。
| 专业 | 录取人数 | 参加考试人数 | 录取率 | 全省计划数 | 占计划数比例 |
| 临床医学 | 306 | 1289 | 23.74% | 770 | 39.74% |
| 口腔医学 | 20 | 283 | 7.07% | 50 | 40.00% |
| 康复治疗技术 | 76 | 154 | 49.35% | 280 | 27.14% |
| 护理学 | 140 | 742 | 18.87% | 590 | 23.73% |
| 医学检验技术 | 34 | 296 | 11.49% | 170 | 20.00% |
| 药学 | 45 | 92 | 48.91% | 330 | 13.64% |
| 合计 | 621 | 2856 | 21.74% | 2190 | 28.36% |
口腔医学专业在专升本招生计划少，考生多，竞争激烈的情况下，录取20人，占口腔医学专业全省招生计划的40%，保持全省第一。
药学专业是校级特色专业，校企联合共建专业，鲁西南制药人才培养培训基地。2018年菏泽医学专科学校药学专业应届毕业生108人，参加专升本考试92人，录取45人，录取率为48.91%。
康复治疗技术专业自2013年创立始，菏泽医学专科学校持续加大专业建设投入，发展迅速。2018年康复治疗技术专业参加专升本考试154人，录取率接近50%。
创造一时的辉煌并不难，难的是如何将成绩保持下去。菏泽医学专科学校将继续强化教学工作的中心地位，把持续提升教育教学质量和内涵建设做为首要任务常抓不懈，不断加大教学投入，加强师资队伍建设，深化教学改革。全校师生将不忘初心，攻坚克难，续写佳绩。
