工商管理系创建于1982年，是北京经济管理职业学院建系最早、规模最大的教学系。现开设工商企业管理、市场营销、电子商务、旅游管理四个专业和工商企业管理安全管理方向，其中工商企业管理专业为北京市特色专业。拥有经营管理模拟系统、电子商务实验系统、旅游酒店实验系统等先进的教学设施和企业实训基地。
工商管理系拥有一支教学经验丰富、专业结构合理、年富力强的“双师型”师资队伍，现有专职教师23人，其中教授4人，副教授11人，博士3名。硕士研究生以上学历教师占到95%；80%的教师具有“双师”资格；先后有6人被评为北京市中青年骨干教师，有1人享受国务院特殊津贴。现任教师大多毕业于国内重点大学，部分具有英国、澳大利亚、香港等国际教育背景。依托北京市国资委，聘请北京市市属企业管理专家担任教学任务，以培养学生的综合素质和能力。
工商管理系紧紧围绕用人单位对高职人才的实际需求，加强专业开发和学生就业指导工作，近三年毕业生就业率均在98%以上，毕业生广泛就业于北京各类企业、事业单位的一线管理岗位，不少学生已经成长为企事业单位的中高层管理人员。
近年来工商管理系承担了多项国家级、市级科研项目，共完成各类科研成果120余项，其中国家和省部级课题4项、专著6部、教材13部、译著6部、论文55篇、企业调研报告36篇。9篇科研论文被权威期刊转载。先后完成教育部《新世纪高职高专教育人才培养模式和教学内容体系改革与建设项目计划》II15-1项目子课题1项；完成北京市教委高等棋牌网页游戏平台 改革立项课题4项，其中《以能力培养为主的互动式教学模式研究》获得北京市教育教学改革优秀成果二等奖；完成北京市社会科学十五规划课题《北京市中小企业改制问题研究》；承担编写出版了工商管理干部系列培训教材、高职高专教材规划教材3套，分别由北京大学出版社、清华大学出版社和北京交通大学出版社出版。《企业管理创新理论与实务》、《管理沟通理论与实务》被评为北京市精品教材；《管理经济学》被评为北京市精品课程。
目前，工商管理系正在承担北京市精品教材立项《物流与供应链管理》、《网络商务技能》，以及北京市教育科学规划课题立项《职业技能导向的情境体验培训模式设计与实施研究》等。
