建筑工程系是内蒙古建筑职业技术学院成立最早、师资力量最雄厚的重点系之一。下设建筑工程技术和工程测量技术两个专业，其中建筑工程技术专业是学院重点建设的品牌专业之一，也是教育部批准的国家级教学改革试点专业之一。
建筑工程系共设四个教研室：建筑施工教研室、土木结构教研室、工程测量技术教研室和建筑材料教研室，现有教职工81人，其中副高级以上职称20人，中级职称26人，“双师型”素质教师达80%以上，博士在读2人，硕士研究生31人，本科以上学历75人。建筑工程系获自治区先导型系、自治区教育先进集体，其中《“2+0.5+0.5”人才培养模式研究与实践》获得了自治区教学成果一等奖。
建系以来，为国家和自治区培养了多批建设及相关行业急需的应用型人才。本系各专业的就业形势良好，部分专业甚至出现供不应求的现象。所有专业在每年9月份一次性合同签约率均在95%以上，年内就业率可达100% 。
