2002年，青海大学向省教育厅上报《青海大学关于筹建二级学院的申请报告》，申请筹建二级学院。
2003年2月，省教育厅下发《关于青海大学筹建二级学院的批复》，根据文件有关规定，2003年2月青海大学与西部矿业有限责任公司双方协商共同试办二级学院，并签订了合作协议书。
2004年2月，教育部下发《关于对青海省普通高等学校举办的独立学院的确认通知》。
2004年3月，省教育厅下发《关于青海大学昆仑学院予以确认的通知》。我院成为我省唯一一所普通本科独立学院。
2004年7月，学院开始招生，在青海大学主校区办学。
2009年9月，经青海大学本科教学资源整合，正式搬迁至现校区，形成两校区办学格局。
