学院创建于2002年3月，由原哈尔滨市经济管理干部学院等七所院校合并组建。2001年6月，哈尔滨市政府第81次常务会议决定，将哈尔滨市经济管理干部学院、哈尔滨市建设职工大学、哈尔滨市财贸职工大学、哈尔滨市职工轻工学院、哈尔滨市科技职工大学、哈尔滨市机电职工大学、哈尔滨机电工程学校等七所院校合并，组建哈尔滨职业技术学院。2001年8月，哈尔滨市委批准组建哈尔滨职业技术学院筹备工作委员会。2002年3月，黑龙江省政府正式批复组建哈尔滨职业技术学院。2002年6月，哈尔滨市委批准组建哈尔滨职业技术学院领导班子。建院伊始，学院明确提出“建设新校园、建立新机制、创造新业绩”的总体目标要求，校园建设和人员安置作为学院实体合并的重要基础工作，成为学院筹建工作的重中之重，为学院开好局、起好步奠定基础。