学校拥有优良的教学科研基地和实践教学基地,有1个国家重点野外科学观测台站(即帽儿山森林生态系统定位站);有森林植物生态学、生物质材料科学与技术、林木遗传育种与生物技术、东北油田盐碱植被恢复与重建(立项建设)4个教育部重点实验室,4个国家林业局重点实验室,5个省级重点实验室,7个省教育厅重点实验室;有1个教育部工程研究中心,1个高等学校学科创新引智基地,2个国家林业局生态系统定位研究站,1个省中试基地,2个省普通高校人文社会科学重点研究基地,2个省中小企业共性技术研发推广中心;有东北林业大学大庆生物技术研究院、植物资源生态与分子工程研究院等37个研究机构;有帽儿山实验林场、凉水实验林场等10个校内实习基地和190个校外实习基地。